База данных и содержимое файлового сервера (устройства файл сервера) - это единое целое. Они связаны друг с другом один к одному. Нельзя один файл сервер использовать на разных БД.
Процесс бакапа должен выглядеть следующим образом - делаете бакап БД средствами SQL сервера (при этом нужно обеспечить чтобы никто не работал с данной базой данных). Сохраняете (копируете) содержимое всех устройств файл серверов с сохранением структуры папок ( для надежности лучше сложить каждое устройство в отдельный файл или папку, сохраняя имя файл сервера и устройства).
Все это вместе - бакап БД и архив всех устройств и будет являться полным бакапом БД.
Разматывается этот так - делаете ресторе БД средствами SQL сервера,
копируете сохраненное содержимое устройств сохраняя структуру файл-сервер\том (как рекомендовалось именовать). Естесвенно пути надо создавать новые, а не замещать какие либо существующие.
Инсталлируете файл сервер(а) на компьютере(ах) где развернули устройства, запускаете программу TechnologiCS Администратор (ну перед этим конечно все с конфигуратором надо сделать), и настраивате в БД файл-сервера и новые пути устройств.
Рекомендуется так же перед бакапом сделать "сборку мусора" программой TechnologiCS Администратор.
С версии 4.0 процедура бакапа/ресторе БД вместе с файл-серверами будет делаться специальной утилитой.